CDH13

CDH13
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2V37
Ідентифікатори
Символи	CDH13, CDHH, P105, cadherin 13
Зовнішні ІД	OMIM: 601364 MGI: 99551 HomoloGene: 20335 GeneCards: CDH13
Пов'язані генетичні захворювання
	пародонтит, шизофренія, депресія клінічна, розлад дефіциту уваги та гіперактивності
Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з іоном кальцію; • гомодимеризація білків; • adiponectin binding; • зв'язування з кадгерином; • зв’язування з іоном металу; • low-density lipoprotein particle binding; • lipoprotein particle binding; • cytoskeletal protein binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • мембрана; • focal adhesion; • клітинна мембрана; • перинуклеарна ділянка цитоплазми; • caveola; • anchored component of membrane; • neuron projection; • екзосома; • зовнішня поверхня плазматичної мембрани; • міжклітинний простір; • GO:0005578 позаклітинний матрикс; • extracellular region; • поверхня клітини; • катеніновий комплекс; • синапс; • collagen-containing extracellular matrix; • ГАМК-ергічний синапс;
Біологічний процес	• calcium-dependent cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules; • regulation of endocytosis; • positive regulation of smooth muscle cell proliferation; • negative regulation of cell adhesion; • positive regulation of calcium-mediated signaling; • positive regulation of endothelial cell proliferation; • positive regulation of cell-matrix adhesion; • positive regulation of cell migration; • low-density lipoprotein particle mediated signaling; • regulation of epidermal growth factor receptor signaling pathway; • sprouting angiogenesis; • відгук на органічну речовину; • positive regulation of positive chemotaxis; • keratinocyte proliferation; • адгезія клітин; • Rho protein signal transduction; • GO:0007067 мітоз; • Rac protein signal transduction; • localization within membrane; • adherens junction organization; • endothelial cell migration; • негативна регуляція проліферації клітин; • lamellipodium assembly; • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • GO:0000767 cell morphogenesis; • cell-cell junction assembly; • cell-cell adhesion mediated by cadherin; • cell-cell adhesion;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	1012
	12554
	ENSG00000140945
	ENSMUSG00000031841
	P55290
	Q9WTR5
NM_001220488; NM_001220489; NM_001220490; NM_001220491; NM_001220492;
	NM_001257
	NM_019707
NP_001207417; NP_001207418; NP_001207419; NP_001207420; NP_001207421;
	NP_001248
	NP_062681
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CDH13 (англ. Cadherin 13) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 713 амінокислот, а молекулярна маса — 78 287^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MQPRTPLVLC	VLLSQVLLLT	SAEDLDCTPG	FQQKVFHINQ	PAEFIEDQSI
LNLTFSDCKG	NDKLRYEVSS	PYFKVNSDGG	LVALRNITAV	GKTLFVHART
PHAEDMAELV	IVGGKDIQGS	LQDIFKFART	SPVPRQKRSI	VVSPILIPEN
QRQPFPRDVG	KVVDSDRPER	SKFRLTGKGV	DQEPKGIFRI	NENTGSVSVT
RTLDREVIAV	YQLFVETTDV	NGKTLEGPVP	LEVIVIDQND	NRPIFREGPY
IGHVMEGSPT	GTTVMRMTAF	DADDPATDNA	LLRYNIRQQT	PDKPSPNMFY
IDPEKGDIVT	VVSPALLDRE	TLENPKYELI	IEAQDMAGLD	VGLTGTATAT
IMIDDKNDHS	PKFTKKEFQA	TVEEGAVGVI	VNLTVEDKDD	PTTGAWRAAY
TIINGNPGQS	FEIHTNPQTN	EGMLSVVKPL	DYEISAFHTL	LIKVENEDPL
VPDVSYGPSS	TATVHITVLD	VNEGPVFYPD	PMMVTRQEDL	SVGSVLLTVN
ATDPDSLQHQ	TIRYSVYKDP	AGWLNINPIN	GTVDTTAVLD	RESPFVDNSV
YTALFLAIDS	GNPPATGTGT	LLITLEDVND	NAPFIYPTVA	EVCDDAKNLS
VVILGASDKD	LHPNTDPFKF	EIHKQAVPDK	VWKISKINNT	HALVSLLQNL
NKANYNLPIM	VTDSGKPPMT	NITDLRVQVC	SCRNSKVDCN	AAGALRFSLP
SVLLLSLFSL	ACL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

Lee S.W. (1996). H-cadherin, a novel cadherin with growth inhibitory functions and diminished expression in human breast cancer. Nat. Med. 2: 776—782. PMID 8673923 doi:10.1038/nm0796-776
Sato M., Mori Y., Sakurada A., Fujimura S., Horii A. (1998). The H-cadherin (CDH13) gene is inactivated in human lung cancer. Hum. Genet. 103: 96—101. PMID 9737784 doi:10.1007/s004390050790
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Niermann T., Kern F., Erne P., Resink T. (2000). The glycosyl phosphatidylinositol anchor of human T-cadherin binds lipoproteins. Biochem. Biophys. Res. Commun. 276: 1240—1247. PMID 11027617 doi:10.1006/bbrc.2000.3465
Tanihara H., Sano K., Heimark R.L., St John T., Suzuki S. (1994). Cloning of five human cadherins clarifies characteristic features of cadherin extracellular domain and provides further evidence for two structurally different types of cadherin. Cell Adhes. Commun. 2: 15—26. PMID 7982033