ATG12

ATG12
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4GDK, 4GDL, 4NAW
Ідентифікатори
Символи	ATG12, APG12, APG12L, FBR93, HAPG12, autophagy related 12
Зовнішні ІД	OMIM: 609608 MGI: 1914776 HomoloGene: 37953 GeneCards: ATG12
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми; • Atg8 ligase activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • phagophore assembly site membrane; • phagocytic vesicle membrane; • Atg12-Atg5-Atg16 complex; • мембрана; • autophagosome; • GO:0009327 protein-containing complex;
Біологічний процес	• автофагія; • autophagy of nucleus; • C-terminal protein lipidation; • autophagy of mitochondrion; • macroautophagy; • autophagosome assembly;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	9140
	67526
	ENSG00000145782
	ENSMUSG00000032905
	O94817
	Q9CQY1
	NM_001277783; NM_004707
	NM_026217
	NP_001264712; NP_004698
	NP_080493
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

ATG12 (англ. Autophagy related 12) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 140 амінокислот, а молекулярна маса — 15 113^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAEEPQSVLQ	LPTSIAAGGE	GLTDVSPETT	TPEPPSSAAV	SPGTEEPAGD
TKKKIDILLK	AVGDTPIMKT	KKWAVERTRT	IQGLIDFIKK	FLKLVASEQL
FIYVNQSFAP	SPDQEVGTLY	ECFGSDGKLV	LHYCKSQAWG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, убіквітинування білків, автофагія, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, мембрані.

Література

Mizushima N., Sugita H., Yoshimori T., Ohsumi Y. (1998). A new protein conjugation system in human. The counterpart of the yeast Apg12p conjugation system essential for autophagy. J. Biol. Chem. 273: 33889—33892. PMID 9852036 doi:10.1074/jbc.273.51.33889
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Tanida I., Tanida-Miyake E., Ueno T., Kominami E. (2001). The human homolog of Saccharomyces cerevisiae Apg7p is a Protein-activating enzyme for multiple substrates including human Apg12p, GATE-16, GABARAP, and MAP-LC3. J. Biol. Chem. 276: 1701—1706. PMID 11096062 doi:10.1074/jbc.C000752200
Tanida I., Nishitani T., Nemoto T., Ueno T., Kominami E. (2002). Mammalian Apg12p, but not the Apg12p.Apg5p conjugate, facilitates LC3 processing. Biochem. Biophys. Res. Commun. 296: 1164—1170. PMID 12207896 doi:10.1016/S0006-291X(02)02057-0
Tanida I., Tanida-Miyake E., Komatsu M., Ueno T., Kominami E. (2002). Human Apg3p/Aut1p homologue is an authentic E2 enzyme for multiple substrates, GATE-16, GABARAP, and MAP-LC3, and facilitates the conjugation of hApg12p to hApg5p. J. Biol. Chem. 277: 13739—13744. PMID 11825910 doi:10.1074/jbc.M200385200
Shao Y., Gao Z., Feldman T., Jiang X. (2007). Stimulation of ATG12-ATG5 conjugation by ribonucleic acid. Autophagy. 3: 10—16. PMID 16963840 doi:10.4161/auto.3270

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:588 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, O94817 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 5

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:588 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, O94817 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]