AICDA

AICDA
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	5JJ4
Ідентифікатори
Символи	AICDA, AID, ARP2, CDA2, HEL-S-284, HIGM2, activation-induced cytidine deaminase, activation induced cytidine deaminase
Зовнішні ІД	OMIM: 605257 MGI: 1342279 HomoloGene: 7623 GeneCards: AICDA
шифр КФ	3.5.4.38
Пов'язані генетичні захворювання
	hyper-IgM syndrome type 2
Онтологія гена
Молекулярна функція	• hydrolase activity, acting on carbon-nitrogen (but not peptide) bonds, in cyclic amidines; • зв'язування з іонами цинку; • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми; • каталітична активність; • гідролазна активність; • зв'язування з убіквітинпротеїнлігазою; • зв’язування з іоном металу; • активність цитидиндезамінази; • identical protein binding; • зв'язування з РНК;
Клітинна компонента	• Екзосома; • клітинне ядро; • цитоплазма; • P-тільце; • GO:0009327 protein-containing complex;
Біологічний процес	• somatic hypermutation of immunoglobulin genes; • DNA demethylation; • процесинг мРНК; • B cell differentiation; • somatic diversification of immunoglobulins; • negative regulation of DNA methylation-dependent heterochromatin assembly; • cytidine deamination; • cellular response to lipopolysaccharide; • Перемикання класу імуноглобулінів; • defense response to bacterium; • regulation of DNA stability; • negative regulation of transposition; • cytidine to uridine editing; • regulation of nuclear cell cycle DNA replication; • negative regulation of single stranded viral RNA replication via double stranded DNA intermediate; • defense response to virus; • DNA cytosine deamination;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	57379
	11628
	ENSG00000111732
	ENSMUSG00000040627
	Q9GZX7
	Q9WVE0
	NM_020661; NM_001330343
	NM_009645
	NP_001317272; NP_065712
	NP_033775
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

AICDA (англ. Activation induced cytidine deaminase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 198 амінокислот, а молекулярна маса — 23 954^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDSLLMNRRK	FLYQFKNVRW	AKGRRETYLC	YVVKRRDSAT	SFSLDFGYLR
NKNGCHVELL	FLRYISDWDL	DPGRCYRVTW	FTSWSPCYDC	ARHVADFLRG
NPNLSLRIFT	ARLYFCEDRK	AEPEGLRRLH	RAGVQIAIMT	FKDYFYCWNT
FVENHERTFK	AWEGLHENSV	RLSRQLRRIL	LPLYEVDDLR	DAFRTLGL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до гідролаз. Задіяний у такому біологічному процесі як процесінг мРНК. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Muto T., Muramatsu M., Taniwaki M., Kinoshita K., Honjo T. (2000). Isolation, tissue distribution, and chromosomal localization of the human activation-induced cytidine deaminase (hAID) gene. Genomics. 68: 85—88. PMID 10950930 doi:10.1006/geno.2000.6268
Martin A., Scharff M.D. (2002). Somatic hypermutation of the AID transgene in B and non-B cells. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99: 12304—12308. PMID 12202747 doi:10.1073/pnas.192442899
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Pasqualucci L., Kitaura Y., Gu H., Dalla-Favera R. (2006). PKA-mediated phosphorylation regulates the function of activation-induced deaminase (AID) in B cells. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 103: 395—400. PMID 16387847 doi:10.1073/pnas.0509969103
Guo J.U., Su Y., Zhong C., Ming G.L., Song H. (2011). Hydroxylation of 5-methylcytosine by TET1 promotes active DNA demethylation in the adult brain. Cell. 145: 423—434. PMID 21496894 doi:10.1016/j.cell.2011.03.022
Demorest Z.L., Li M., Harris R.S. (2011). Phosphorylation directly regulates the intrinsic DNA cytidine deaminase activity of activation-induced deaminase and APOBEC3G protein. J. Biol. Chem. 286: 26568—26575. PMID 21659520 doi:10.1074/jbc.M111.235721