Транслін

TSN
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1J1J, 3PJA, 3QB5, 4WYV
Ідентифікатори
Символи	TSN, BCLF-1, C3PO, RCHF1, REHF-1, TBRBP, TRSLN, translin
Зовнішні ІД	OMIM: 600575 MGI: 109263 HomoloGene: 3397 GeneCards: TSN
Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з ДНК; • nuclease activity; • endonuclease activity; • специфічне до послідовності зв'язування з ДНК; • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми; • mRNA binding; • гідролазна активність; • зв'язування з РНК; • single-stranded DNA binding; • identical protein binding; • endoribonuclease activity; • GO:0032403 protein-containing complex binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• DNA recombination; • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis; • RNA metabolic process; • RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic; • GO:0070919 production of siRNA involved in RNA interference;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	7247
	22099
	ENSG00000211460
	ENSMUSG00000026374
	Q15631
	Q62348
	NM_001261401; NM_004622
	NM_011650
	NP_001248330; NP_004613
	NP_035780
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TSN (англ. Translin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 228 амінокислот, а молекулярна маса — 26 183^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSVSEIFVEL	QGFLAAEQDI	REEIRKVVQS	LEQTAREILT	LLQGVHQGAG
FQDIPKRCLK	AREHFGTVKT	HLTSLKTKFP	AEQYYRFHEH	WRFVLQRLVF
LAAFVVYLET	ETLVTREAVT	EILGIEPDRE	KGFHLDVEDY	LSGVLILASE
LSRLSVNSVT	AGDYSRPLHI	STFINELDSG	FRLLNLKNDS	LRKRYDGLKY
DVKKVEEVVY	DLSIRGFNKE	TAAACVEK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, нуклеаз, ендонуклеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Aoki K., Inazawa J., Takahashi T., Nakahara K., Kasai M. (1997). Genomic structure and chromosomal localization of the gene encoding translin, a recombination hotspot binding protein. Genomics. 43: 237—241. PMID 9244443 doi:10.1006/geno.1997.4796
Aoki K., Suzuki K., Ishida R., Kasai M. (1999). The DNA binding activity of Translin is mediated by a basic region in the ring-shaped structure conserved in evolution. FEBS Lett. 443: 363—366. PMID 10025964 doi:10.1016/S0014-5793(99)00010-1
Erdemir T., Bilican B., Oncel D., Goding C.R., Yavuzer U. (2002). DNA damage-dependent interaction of the nuclear matrix protein C1D with Translin-associated factor X (TRAX). J. Cell Sci. 115: 207—216. PMID 11801738

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12379 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q15631 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 2

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12379 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q15631 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]