Кератин-10

Кератин-10
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4F1Z, 3ASW, 4ZRY
Ідентифікатори
Символи	KRT10, BCIE, BIE, CK10, EHK, K10, KPP, keratin 10
Зовнішні ІД	OMIM: 148080 MGI: 96685 GeneCards: KRT10
Пов'язані генетичні захворювання
	epidermolytic hyperkeratosis, ichthyosis with confetti
Онтологія гена
Молекулярна функція	• structural molecule activity; • structural constituent of skin epidermis; • активність гетеродимеризації білків; • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • екзосома; • Проміжні філаменти; • мембрана; • клітинне ядро; • міжклітинний простір; • гіалоплазма; • зроговіла оболонка; • extracellular region; • поверхня клітини;
Біологічний процес	• keratinocyte differentiation; • keratinization; • cornification; • GO:0051357, GO:0051358, GO:0051359 peptide cross-linking; • positive regulation of epidermis development; • protein heterotetramerization;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	3858
	16661
	ENSG00000186395
	ENSMUSG00000019761
	P13645
	P02535
	NM_000421; NM_001379366
	NM_010660
	NP_000412; NP_001366295
	NP_034790
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

Кератин-10 (англ. Keratin 10) – білок, який кодується геном KRT10, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 584 амінокислот, а молекулярна маса — 58 827^[5]. Належить до великої родини кератинів — структурних білків цитоскелету.

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSVRYSSSKH	YSSSRSGGGG	GGGGCGGGGG	VSSLRISSSK	GSLGGGFSSG
GFSGGSFSRG	SSGGGCFGGS	SGGYGGLGGF	GGGSFRGSYG	SSSFGGSYGG
IFGGGSFGGG	SFGGGSFGGG	GFGGGGFGGG	FGGGFGGDGG	LLSGNEKVTM
QNLNDRLASY	LDKVRALEES	NYELEGKIKE	WYEKHGNSHQ	GEPRDYSKYY
KTIDDLKNQI	LNLTTDNANI	LLQIDNARLA	ADDFRLKYEN	EVALRQSVEA
DINGLRRVLD	ELTLTKADLE	MQIESLTEEL	AYLKKNHEEE	MKDLRNVSTG
DVNVEMNAAP	GVDLTQLLNN	MRSQYEQLAE	QNRKDAEAWF	NEKSKELTTE
IDNNIEQISS	YKSEITELRR	NVQALEIELQ	SQLALKQSLE	ASLAETEGRY
CVQLSQIQAQ	ISALEEQLQQ	IRAETECQNT	EYQQLLDIKI	RLENEIQTYR
SLLEGEGSSG	GGGRGGGSFG	GGYGGGSSGG	GSSGGGHGGG	HGGSSGGGYG
GGSSGGGSSG	GGYGGGSSSG	GHGGSSSGGY	GGGSSGGGGG	GYGGGSSGGG
SSSGGGYGGG	SSSGGHKSSS	SGSVGESSSK	GPRY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Література

Rieger M., Franke W.W. (1988). Identification of an orthologous mammalian cytokeratin gene. High degree of intron sequence conservation during evolution of human cytokeratin 10. J. Mol. Biol. 204: 841—856. PMID 2464696 doi:10.1016/0022-2836(88)90045-9
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Darmon M.Y., Semat A., Darmon M.C., Vasseur M. (1987). Sequence of a cDNA encoding human keratin No 10 selected according to structural homologies of keratins and their tissue-specific expression. Mol. Biol. Rep. 12: 277—283. PMID 2448602 doi:10.1007/BF00444680
Rothnagel J.A., Longley M.A., Holder R.A., Kuster W., Roop D.R. (1994). Prenatal diagnosis of epidermolytic hyperkeratosis by direct gene sequencing. J. Invest. Dermatol. 102: 13—16. PMID 7507150 doi:10.1111/1523-1747.ep12371723
Tkachenko A.V., Buchman V.L., Bliskovsky V.V., Shvets Y.P., Kisselev L.L. (1992). Exons I and VII of the gene (Ker10) encoding human keratin 10 undergo structural rearrangements within repeats. Gene. 116: 245—251. PMID 1378806 doi:10.1016/0378-1119(92)90521-P
Korge B.P., Gan S.-Q., McBridge O.W., Mischke D., Steinert P.M. (1992). Extensive size polymorphism of the human keratin 10 chain resides in the C-terminal V2 subdomain due to variable numbers and sizes of glycine loops. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 89: 910—914. PMID 1371013 doi:10.1073/pnas.89.3.910