CASP2

CASP2
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1PYO, 2P2C, 3R5J, 3R6G, 3R6L, 3R7B, 3R7N, 3R7S, 3RJM
Ідентифікатори
Символи	CASP2, CASP-2, ICH1, NEDD-2, NEDD2, PPP1R57, caspase 2
Зовнішні ІД	OMIM: 600639 MGI: 97295 HomoloGene: 7254 GeneCards: CASP2
шифр КФ	3.4.22.55
Реагує на сполуку
	emricasan
Онтологія гена
Молекулярна функція	• активність цистеїнової пептидази; • protein domain specific binding; • GO:0070122 peptidase activity; • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми; • enzyme binding; • гідролазна активність; • identical protein binding; • cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process; • cysteine-type endopeptidase activity; • cysteine-type endopeptidase activity involved in execution phase of apoptosis;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • мембрана; • мітохондрія; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrest; • execution phase of apoptosis; • protein processing; • GO:0010260 старіння людини; • positive regulation of apoptotic signaling pathway; • luteolysis; • cellular response to mechanical stimulus; • positive regulation of neuron apoptotic process; • brain development; • intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage; • extrinsic apoptotic signaling pathway in absence of ligand; • позитивна регуляція апоптозу; • ectopic germ cell programmed cell death; • apoptotic signaling pathway; • neural retina development; • GO:0097285 апоптоз; • regulation of apoptotic process; • протеоліз; • negative regulation of apoptotic process;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	835
	12366
	ENSG00000106144
	ENSMUSG00000029863
	P42575
	P29594
	NM_032983; NM_001224; NM_032982; NM_032984
	NM_007610
	NP_001215; NP_116764; NP_116765
	NP_031636
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CASP2 (англ. Caspase 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 452 амінокислот, а молекулярна маса — 50 685^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAAPSAGSWS	TFQHKELMAA	DRGRRILGVC	GMHPHHQETL	KKNRVVLAKQ
LLLSELLEHL	LEKDIITLEM	RELIQAKVGS	FSQNVELLNL	LPKRGPQAFD
AFCEALRETK	QGHLEDMLLT	TLSGLQHVLP	PLSCDYDLSL	PFPVCESCPL
YKKLRLSTDT	VEHSLDNKDG	PVCLQVKPCT	PEFYQTHFQL	AYRLQSRPRG
LALVLSNVHF	TGEKELEFRS	GGDVDHSTLV	TLFKLLGYDV	HVLCDQTAQE
MQEKLQNFAQ	LPAHRVTDSC	IVALLSHGVE	GAIYGVDGKL	LQLQEVFQLF
DNANCPSLQN	KPKMFFIQAC	RGDETDRGVD	QQDGKNHAGS	PGCEESDAGK
EKLPKMRLPT	RSDMICGYAC	LKGTAAMRNT	KRGSWYIEAL	AQVFSERACD
MHVADMLVKV	NALIKDREGY	APGTEFHRCK	EMSEYCSTLC	RHLYLFPGHP
PT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, ацетилювання, альтернативний сплайсинг.

Література

Wang L., Miura M., Bergeron L., Zhu H., Yuan J. (1994). Ich-1, an Ice/ced-3-related gene, encodes both positive and negative regulators of programmed cell death. Cell. 78: 739—750. PMID 8087842 doi:10.1016/S0092-8674(94)90422-7
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Xue D., Shaham S., Horvitz H.R. (1996). The Caenorhabditis elegans cell-death protein CED-3 is a cysteine protease with substrate specificities similar to those of the human CPP32 protease. Genes Dev. 10: 1073—1083. PMID 8654923 doi:10.1101/gad.10.9.1073
Koseki T., Inohara N., Chen S., Nunez G. (1998). ARC, an inhibitor of apoptosis expressed in skeletal muscle and heart that interacts selectively with caspases. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95: 5156—5160. PMID 9560245 doi:10.1073/pnas.95.9.5156
Tinel A., Tschopp J. (2004). The PIDDosome, a protein complex implicated in activation of caspase-2 in response to genotoxic stress. Science. 304: 843—846. PMID 15073321 doi:10.1126/science.1095432
Vakifahmetoglu H., Olsson M., Orrenius S., Zhivotovsky B. (2006). Functional connection between p53 and caspase-2 is essential for apoptosis induced by DNA damage. Oncogene. 25: 5683—5692. PMID 16652156 doi:10.1038/sj.onc.1209569