Експортин-5

XPO5
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3A6P
Ідентифікатори
Символи	XPO5, exp5, exportin 5
Зовнішні ІД	OMIM: 607845 MGI: 1913789 HomoloGene: 69316 GeneCards: XPO5
Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з тРНК; • mRNA binding; • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми; • зв'язування з РНК; • nuclear export signal receptor activity; • pre-miRNA binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • RNA nuclear export complex; • клітинне ядро; • нуклеоплазма; • гіалоплазма; • nuclear RNA export factor complex;
Біологічний процес	• protein export from nucleus; • positive regulation of RNA interference; • транспорт білків; • intracellular protein transport; • GO:0061715 miRNA metabolic process; • Сайленсинг генів; • regulation of protein export from nucleus; • pre-miRNA export from nucleus; • GO:0015915 транспорт; • nuclear export;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	57510
	72322
	ENSG00000124571
	ENSMUSG00000067150
	Q9HAV4
	Q924C1
	NM_020750
	NM_028198
	NP_065801
	NP_082474
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

XPO5 (англ. Exportin 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 204 амінокислот, а молекулярна маса — 136 311^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAMDQVNALC	EQLVKAVTVM	MDPNSTQRYR	LEALKFCEEF	KEKCPICVPC
GLRLAEKTQV	AIVRHFGLQI	LEHVVKFRWN	GMSRLEKVYL	KNSVMELIAN
GTLNILEEEN	HIKDALSRIV	VEMIKREWPQ	HWPDMLIELD	TLSKQGETQT
ELVMFILLRL	AEDVVTFQTL	PPQRRRDIQQ	TLTQNMERIF	SFLLNTLQEN
VNKYQQVKTD	TSQESKAQAN	CRVGVAALNT	LAGYIDWVSM	SHITAENCKL
LEILCLLLNE	QELQLGAAEC	LLIAVSRKGK	LEDRKPLMVL	FGDVAMHYIL
SAAQTADGGG	LVEKHYVFLK	RLCQVLCALG	NQLCALLGAD	SDVETPSNFG
KYLESFLAFT	THPSQFLRSS	TQMTWGALFR	HEILSRDPLL	LAIIPKYLRA
SMTNLVKMGF	PSKTDSPSCE	YSRFDFDSDE	DFNAFFNSSR	AQQGEVMRLA
CRLDPKTSFQ	MAGEWLKYQL	STFLDAGSVN	SCSAVGTGEG	SLCSVFSPSF
VQWEAMTLFL	ESVITQMFRT	LNREEIPVND	GIELLQMVLN	FDTKDPLILS
CVLTNVSALF	PFVTYRPEFL	PQVFSKLFSS	VTFETVEESK	APRTRAVRNV
RRHACSSIIK	MCRDYPQLVL	PNFDMLYNHV	KQLLSNELLL	TQMEKCALME
ALVLISNQFK	NYERQKVFLE	ELMAPVASIW	LSQDMHRVLS	DVDAFIAYVG
TDQKSCDPGL	EDPCGLNRAR	MSFCVYSILG	VVKRTCWPTD	LEEAKAGGFV
VGYTSSGNPI	FRNPCTEQIL	KLLDNLLALI	RTHNTLYAPE	MLAKMAEPFT
KALDMLDAEK	SAILGLPQPL	LELNDSPVFK	TVLERMQRFF	STLYENCFHI
LGKAGPSMQQ	DFYTVEDLAT	QLLSSAFVNL	NNIPDYRLRP	MLRVFVKPLV
LFCPPEHYEA	LVSPILGPLF	TYLHMRLSQK	WQVINQRSLL	CGEDEAADEN
PESQEMLEEQ	LVRMLTREVM	DLITVCCVSK	KGADHSSAPP	ADGDDEEMMA
TEVTPSAMAE	LTDLGKCLMK	HEDVCTALLI	TAFNSLAWKD	TLSCQRTTSQ
LCWPLLKQVL	SGTLLADAVT	WLFTSVLKGL	QMHGQHDGCM	ASLVHLAFQI
YEALRPRYLE	IRAVMEQIPE	IQKDSLDQFD	CKLLNPSLQK	VADKRRKDQF
KRLIAGCIGK	PLGEQFRKEV	HIKNLPSLFK	KTKPMLETEV	LDNDGGGLAT
IFEP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, РНК-залежне заглушення генів, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з РНК, тРНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Brownawell A.M., Macara I.G. (2002). Exportin-5, a novel karyopherin, mediates nuclear export of double-stranded RNA binding proteins. J. Cell Biol. 156: 53—64. PMID 11777942 doi:10.1083/jcb.200110082
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Calado A., Treichel N., Mueller E.-C., Otto A., Kutay U. (2002). Exportin-5-mediated nuclear export of eukaryotic elongation factor 1A and tRNA. EMBO J. 21: 6216—6224. PMID 12426393 doi:10.1093/emboj/cdf620
Yi R., Qin Y., Macara I.G., Cullen B.R. (2003). Exportin-5 mediates the nuclear export of pre-microRNAs and short hairpin RNAs. Genes Dev. 17: 3011—3016. PMID 14681208 doi:10.1101/gad.1158803
Chen T., Brownawell A.M., Macara I.G. (2004). Nucleocytoplasmic shuttling of JAZ, a new cargo protein for exportin-5. Mol. Cell. Biol. 24: 6608—6619. PMID 15254228 doi:10.1128/MCB.24.15.6608-6619.2004
Bohnsack M.T., Czaplinski K., Goerlich D. (2004). Exportin 5 is a RanGTP-dependent dsRNA-binding protein that mediates nuclear export of pre-miRNAs. RNA. 10: 185—191. PMID 14730017 doi:10.1261/rna.5167604

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17675 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9HAV4 (англ.) . Архів оригіналу за 26 серпня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 6

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17675 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q9HAV4 (англ.) . Архів оригіналу за 26 серпня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]